單細胞全轉錄組測序新技術邁入新階段
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2014年4月29日，生物動態光學成像中心黃巖誼、湯富酬課題組在《美國科學院院刊》(PNAS)上發表題為Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing的論文。該研究利用微流控芯片技術實現了高質量單細胞的全轉錄組測序樣品準備，全面提高了單細胞全轉錄組分析的準確性和可靠性。
單細胞測序利用新一代的測序技術來分析單個細胞內的基因信息，成為解讀單細胞的最佳工具。單細胞全轉錄組測序是單細胞高通量測序需求量最大的應用，它所測定的是單個細胞內所有基因的表達量，同時還可以測定除了mRNA分子外，其他長非編碼rna(lncRNA) 以及小RNA的含量，定量獲取單個細胞完整的表達譜。目前采用的新一代測序技術中，絕大多數方法都需要特定的前處理過程，制備“測序文庫”。而針對單細胞 樣品，已有的方法均存在很多缺陷，導致檢測靈敏度不高、基因表達信息丟失嚴重、技術噪音高、操作失誤率高、重復性差。
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| 通過多個細胞較低深度的轉錄組測序，可以獲取比同等成本下單個細胞高深度測序更 重要的細胞異質性信息，而更好地展現生物體系的復雜性、隨機性和動態過程。而通過微流控芯片上的精確細胞操控和主動俘獲過程，還可以擺脫其他類似方法中隨 機俘獲的局限性，實現對極其少量細胞的完全俘獲和反應前的表型觀察，以更好地理解和驗證單個細胞的異質性。與已有的技術相比，這一工作展示了目前最好的單 細胞轉錄組測序檢測靈敏度和平行性。 |